2023年度　パラフィンブロックのDNA・RNA品質チェック

●サーベイ回答期間：2023年7月27日（木）～2023年8月31日（木）

本オプションサーベイはFFPEブロックから抽出されるDNA・RNAの品質確認サーベイとなります。下記の手順に沿って検体のご準備、送付をお願い致します。なお、本サーベイ結果(判定・回答及びアンケート記載内容)について、結果報告書や統計・解析、資料作成などに使用させて頂くことがございます。
その際には、当該施設を識別できない状態として使用いたします。
また、各施設からの検体は本サーベイ解析終了後、一定期間保管をさせて頂き、その後破棄いたします。

手順書 アンケート回答

１：送付物

1. 1) 手順書
2. 2) 2.0 mlスクリューキャップマイクロチューブ　2本　※DNA・RNAどちらかの参加の場合は1本
3. 3) 1.5 mlマイクロチューブ　2本　※DNA・RNAどちらかの参加の場合は1本
4. 4) チャック付きポリ袋　1枚
5. 5) HE染色標本を入れる標本ケース

２：サーベイ実施手順

1. 1) 確認：上記 1)〜5)の送付物を確認してください。
2. 2) 症例選択：以下の基準に基づき症例（FFPEブロック）の選定を行ってください。
   
   1. ① 癌種：肺癌、なければ乳癌、どちらもなければ大腸癌
   2. ② FFPEブロック作製日時：2020年10月から2020年12月の間に手術され、FFPEブロックが作製された手術材料（もしくはFFPEブロック作業後2年半〜3年以内のFFPEブロック）
   3. ③ 大きさ：腫瘍部を10 mm×10 mm以上含むもの

   注1：FFPEブロック作製後、2年半から3年以内のFFPEブロックを対象とします。薄切後、送付、測定までの期間を考慮し、上記②の日時の中で採取された検体で検討を行いたく、ご協力をお願いいたします。

   注２：今回は、FFPEブロックから抽出されるDNA・RNAの品質確認のため、マイクロダイセクションはせず、切片全体での品質確認となります。品質確認には濃度が10 ng/ul以上のDNA、25 ng/ul以上のRNAが必要となります。適切な濃度を満たさなければ、品質の正確な測定ができなくなる可能性がありますので、上記③を参考にFFPEブロックをご選定ください。

3. 3) HE標本作製：選定したブロックから1枚目は通常の診療に用いる手順で、HE標本を作製してください。
   1. ① 自施設にあるスライドガラスを使用し、HE染色標本を1枚作製します。フロスト部分には施設名と施設番号を記載してください。（病理番号は書かないでください）（下記HE染色標本写真参照）
   2. ② 作製後、上記、10 mm×10 mmの範囲に腫瘍細胞が含まれていることを確認してください。マクロダイセクションは行ないませんので、腫瘍部のマーキングは不要です。
   3. ③ 封入後、封入剤が完全に乾いてからHE染色標本を標本ケースに入れます。
   4. ④ 標本ケースに入れたHE染色標本は室温で保管します。
4. 4) 核酸抽出用の薄切切片作製：選定したブロックから2枚目以降、ゲノム診療用病理組織検体取り扱い規定（日本病理学会）を参照し薄切してください。
   1. ① FFPEブロックから、厚さ10μmでロール状に連続切片で8枚薄切します。
   2. ② 4本のチューブにパラフィンロールをそれぞれ2枚ずつ入れます。（チューブには、事前に書かれている施設番号以外は記載しないでください。）
   3. ③ チューブの蓋が開かないように、パラフィルム等でとめます。
   4. ④ 検体を入れたチューブは室温で保管します。

   ※DNA、RNAどちらかで参加の場合は連続切片で4枚薄切し、2本のチューブに2枚ずつ入れます。

5. 5) 返送：2023年7月27日（木）～ 8月31日（木）

   薄切後、1週間以内にJPQAS事務局に送付してください。
   ・ 薄切切片入りチューブ 4本（2.0ml,1.5mlチューブ 各2本）
   ・ HE染色標本 1枚（送付した標本ケースに入れる）
   全てまとめてチャック付きポリ袋に入れてください。（下記のJPQAS事務局への送付物参照）

   提出した検体に関しお問い合わせをする可能性もありますので、使用した病理番号は施設内で控えておいてください。
   検体は前期サーベイ標本と一緒にJPQAS事務局に送付してください。やむを得ず前期サーベイ標本と別に送付する場合には、JPQAS事務局にお問い合わせください。

6. 6) アンケート回答

   アンケート回答ボタンより各選択症例の情報についてご回答ください。